本发明提供了一种抑制肿瘤干细胞的组合物，采用姜黄素提取物、胡椒碱提取物、灰树花D-组分提取物和有机硒复配制得，本组合物中胡椒碱提高了姜黄素的生物利用度和抗癌活性，且辅以灰树花D-fraction和有机硒的抗癌功效，靶向肿瘤干细胞，可杀灭肿瘤干细胞，提高化疗药物的疗效，防止肿瘤的复发和转移。本组合物可制成片剂、胶囊或口服液，用于制备抗癌药物或保健食品。