本发明提供了一种高效分离脐带间充质干细胞的方法。本发明直接从脐带内分离华通氏胶，避免了杂细胞的污染，无需多次传代，保证了细胞的纯度和活力；能有效的减少脐带分离过程的污染，且能降低分离的成本。在分离过程中不需要机械破碎脐带，减少机械剪切力对细胞的损害，获得的细胞活率更高；由于在分离过程中未采用异种消化酶和异种血清，所以所得到的细胞不含异种蛋白，也更安全，可以满足临床使用的需要，也为建立脐带间充质干细胞库提供了技术保障；采用组织块法的方法，更加方便和快捷，对细胞损伤小，能最大可能的保护间充质干细胞，不受损伤，使其具有更高活率。