本发明提供了一种治疗糖尿病的干细胞制剂及其制备方法，所述干细胞制剂由混匀于生理盐水的骨髓多潜能干细胞、骨髓多潜能干细胞源胰岛样细胞和脂肪干细胞按照1:1:1的比例组成。本发明干细胞制剂所用细胞具有多向分化潜能和高增殖特性，来源丰富，取材方便，取材容易，对机体损伤小，容易进行体外分离、培养和诱导操作，将为细胞治疗糖尿病提供丰富的细胞来源，可在临床上大规模使用。本发明干细胞制剂植入体内无免疫排斥反应。本发明干细胞制剂制备方法使用特定的诱导培养体系，体外使骨髓多潜能干细胞定向分化为胰岛样细胞，解决了在糖尿病持续高血糖状态下植入的细胞很难分化为可分泌胰岛素的细胞困境。