本发明公开了一种检测小鼠内耳干细胞的标记分子及应用，所述的标记分子为Opcml、Phex和Gdf10；本发明筛选出小鼠内耳干细胞特异性的细胞标记分子可以区分小鼠内耳干细胞与其他组织来源的细胞，也可为其他物种内耳干细胞特异性标记分子研究提供参考。