本实用新型公开了一种干细胞运输箱，包括箱体以及设置在箱体上的箱盖，箱体的侧壁的夹层中安装有通过恒温控制器控制的电加热层，所述箱体内部设置有多组干细胞冻存管架，干细胞冻存管架两端通过弹簧架安装有滑块，箱体的侧壁上对称安装有滑轨，滑轨与滑块活动连接，所述箱体底部设有一玻璃皿，玻璃皿的外壁与箱体的内壁形成一储水槽，所述储水槽内安装有雾化快，储水槽的两个出入口处均安装有风扇。本实用新型干细胞冻存管架可以调节高低，从而适应不同长度的试管，且具有很好的保温保湿效果。便于干细胞的运输，特别是长途运输，可保证细胞在运输过程中生长状态良好，减少应激反应。同时，使用者可以方便的实时监控箱体内的状态，便于观察变化。