本发明涉及一种癌症治疗中纳米多药载药体系的制备方法，包括如下步骤：采用阳极氧化法制备AAO模板，并对其进行表面改性，改变表面的亲溶剂性质；把改性模板放置到多种抗癌药物的混合溶液中，在常压或减压条件下辅助制备纳米药物；用酸或碱溶解除去模板，得到单分散且比例、形貌可控的多药纳米结构；清洗后得到纯的单分散纳米药物；合成功能化的表面活性剂分子，同时引入靶向单元；用合成的表面活性剂对纳米药物进行功能化；本发明方法是用模板法辅助制备各种疏水抗癌药物的多药协同纳米结构，改变制备条件可以得到不同配方、形貌和尺寸的纳米药物，所制备的纳米药物具有高的载药量、良好的稳定性、安全性、更低的毒副作用和优异的抗癌活性。