养殖废弃物和农林废弃物密闭好氧制生物有机肥工艺，包括以下步骤：（1）、收集养殖废弃物和农林废弃物，并将两者搅拌混合，使混合物的含水率控制至55%-65%；（2）、将混合物进行一次好氧发酵；（3）、接着将混合物进行二次好氧发酵，混合物的含水率降至30%以下；（4）、对混合物进行粉碎和筛分，制成有机肥；（5）、将筛分后的有机肥均质储存；（6）、将有机肥包装、出库。本发明的工艺简单、处理量大、发酵周期较短、物料发酵程度均匀、处理效果好、自动化程度高、处理成本较低，一次好氧发酵和二次好氧发酵处理均是全封闭运行，处理过程无异味，将农业废弃物化废为宝，生产出极有市场价值的有机肥和液态菌肥。