本发明公开了一种自动过滤注射器，包括注射器和过滤注射针，所述注射针由针管和针座组成，针管安装在上针座的前端，下针座的后端连接到注射器的锥头上，下针座的前端与上针座结合形成吸液入口和注射出口，下针座上安装有止回阀，止回阀在吸液入口的吸液方向及注射出口的注射方向打开，吸液入口上安装有过滤器。过滤和注射过程自动进行，不需要更换针头，本发明的注射器整体结构简单，操作方便、安全可靠、成本低、一次性使用，可有效降低药物杂质和交叉感染风险。