本发明适用于药物分析技术领域，提供一种复方血栓通制剂指纹图谱的检测方法，包括如下步骤：A）供试品溶液的制备；B）参照物溶液的制备；C）复方血栓通制剂指纹图谱的检测：分别吸取参照物溶液和供试品溶液，注入液相色谱仪检测，得到复方血栓通制剂指纹图谱；所述液相色谱仪的检测条件为：色谱柱以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂，以乙腈为流动相A，以0.1%体积百分含量的磷酸溶液为流动相B，进行梯度洗脱，检测波长为270nm，柱温为18～22℃。本发明提供的检测方法可以同时检出黄芪、丹参和玄参中代表性较强的活性成分，重复性好，专属性强，有利于保证产品质量的均一性和稳定性。