本发明涉及一种水产养殖环境水体中孔雀石绿及其代谢物含量检测方法，属于环境质量安全检测技术领域。本发明将水体经预处理后利用多壁碳纳米管固相萃取柱富集净化，液相色谱—串联质谱仪进行定性定量分析。本发明方法操作方便，重现性较好，定性准确且回收率较高，能够快速分析水产养殖环境水体中的孔雀石绿及其代谢物含量。