一种生物兼容并可生物降解的多孔二氧化硅纳米粒子的制备方法，通过多孔碳酸钙纳米粒子为模板一步法合成，用作模板的多孔碳酸钙纳米粒子内部掺杂有明胶或淀粉等生物分子，除去模板之后该生物分子会留在多孔二氧化硅纳米粒子的内部。在生物环境中制备的多孔二氧化硅纳米粒子具有生物相容性和生物可降解性。本发明得到的二氧化硅纳米粒子分散性好，具有丰富的纳米孔隙，可作为一种抗癌药物载体应用于生物医药领域。