本发明公开了一种通过种间杂交获得高比例雄性泥鳅的方法，它是以雌性大鳞副泥鳅与雄性四倍体泥鳅为亲本进行杂交：对雌性大鳞副泥鳅、雄性四倍体泥鳅腹腔注射催产药物，催产12-16小时后，采集雄性四倍体泥鳅的精巢和雌性大鳞副泥鳅的卵粒，将精巢与保存液研磨混匀后再与卵粒混匀，得受精卵，将受精卵进行孵化，饲养孵化后获得的杂交泥鳅苗，得到高比例的雄性泥鳅。采用本发明获得的三倍体杂交泥鳅群体，其中雄性杂交泥鳅的比例高达87.64-98.53%，雌鱼卵巢发育不良。