本发明属于药物分析技术领域，涉及一种枳实药材指纹图谱、其建立方法及用途。具体地，本发明涉及一种枳实药材高效液相色谱（HPLC）指纹图谱及其建立方法，以及枳实药材HPLC指纹图谱和/或标准指纹图谱在鉴别枳实药材中的用途。具体地，枳实药材HPLC指纹图谱的建立方法，包括下述步骤：（1）枳实供试品的制备，和（2）高效液相色谱分析方法。本发明还涉及一种鉴别枳实药材的方法。本发明适于对枳实药材真伪和质量进行鉴别。