本发明公开了一种超微玛咔全效制剂及其制备方法、剂型与应用，所述制剂以玛咔根须或玛咔茎叶中的一种或两种组合为原料经超细处理制得，所述制剂中含有重量比不少于0.5%的芥子油苷。所述方法包括前处理、粗磨、均质处理和制备工序或包括前处理、干燥、粗磨、超微粉碎工序。所述制剂可制备成各种剂型。所述制剂在制备抗疲劳和/或改善性功能和/或改善记忆药物中的应用。本发明将新鲜玛咔全株各部位综合利用，并利用冷冻与超微粉碎技术，充分保留与利用玛咔中的活性成分，实现了玛咔中活性成分全价、全效利用。本发明工艺简便，稳定可靠，活性成分生物利用度高，可广泛用于制备抗疲劳，增强性功能和记忆能力保健品或药物，有效开发利用自然生物资源。