本发明涉及一种含聚合物与磷脂的纳米载药系统，包括聚乳酸-羟基乙酸共聚物、磷脂、药物及二硬脂酰磷脂酰乙醇胺-聚乙二醇-叶酸线性聚合物；其中，聚乳酸-羟基乙酸共聚物包覆药物形成内核；磷脂环绕于聚乳酸-羟基乙酸共聚物表面形成中间层；二硬脂酰磷脂酰乙醇胺-聚乙二醇-叶酸线性化合物以二硬脂酰磷脂酰乙醇胺穿插于磷脂中间层中形成外层，提供聚乙二醇外壳及叶酸靶向配体。上述含聚合物与磷脂的纳米载药系统具备聚合物及纳米脂质体的综合优势，具有生物相容性性好、生物降解可控且降解产物毒性低、易实现靶向控制释放、易于表面功能化等优点。此外，本发明还提供一种简便易行的含聚合物与磷脂的纳米载药系统的制备方法。