本发明三疣梭子蟹内生芽枝霉菌Pt-2抑制AchE的次生代谢产物及其制备方法，属于生物技术领域。所述次生代谢产物是通过下述方法制备所得：(1)、以三疣梭子蟹的内生芽枝霉菌Pt-2为菌种，进行液体发酵，获得发酵物；(2)、将发酵液在40℃下真空浓缩至原体积的1/3，再用乙酸乙酯进行萃取，萃取液浓缩至干；(3)、经浓缩至干的芽枝霉菌Pt-2发酵产物的有机相萃取物，采用硅胶柱层析，氯仿/甲醇体系梯度洗脱，获得6个极性段，对活性最高段采用C18反相柱和葡聚糖凝胶层析进行分离，获得AchE抑制率达70～90％的次生代谢产物。本发明具有克服了目前药物价格昂贵，有副作用，且化学合成难度大的缺点，提供了一种新的药物及制备方法，为预防老年痴呆病生物药品的开发提供理论依据的优点。