本发明涉及天然药物化学领域，具体涉及一种人参皂苷Rk₃和人参皂苷Rh₄顺反异构体的制备方法。其特征是：联用硅胶柱色谱和高速逆流分离，能够快速得到大量高纯度人参皂苷Rk₃和人参皂苷Rh₄顺反异构体。本发明制备方法分离的三个化合物纯度均大于95%。