本发明涉及一种用于克氏原螯虾养殖的底栖饵料生物培养基及其使用方法，将培养基与池底底泥混合后注入经60目筛绢过滤的河水用于培育水生底栖生物及增殖水草。所培养的饵料生物可以替代50%以上人工饲料，养殖成本大幅度降低，同时高品质的底栖饵料生物可以为克氏原螯虾的快速生长提供营养来源，使养成规格、产量和效益得到大幅度的提高；所生产出的优质商品虾可提高市场竞争力、降低养殖成本和降低养殖风险。