本发明涉及一种无定形磷酸钙纳米球及其制备方法，本发明以水溶性钙盐作为钙源、含磷生物分子作为磷源，通过微波辅助水热反应制得所述无定形磷酸钙纳米球。本发明制得的无定形磷酸钙纳米球在水溶液中稳定存在可长达140小时以上，并且还能改善无定形磷酸钙的生物学性能，增强磷酸钙的药物装载能力。